升级后的新版软件ECR50与DNBSEQ-T7专用的甲基化高通量测序试剂套装(T7MethylationFCLPE150)现已同步上线。从今天起,用户可以享受软件升级服务及购买甲基化测序试剂套装,详细的订购指南可在文末查阅。
随着新一代建库产品MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(简称“WGMSV30”)已成功适配DNBSEQ-T7平台,并得益于其升级算法,结合DNBSEQ-T7RS甲基化高通量测序试剂套装,用户在测序时能够显著降低平衡文库的混合比例,甚至可以实现“100%纯甲基化文库”的高质量测序。
用户案例
尊龙凯时的产品在多个城市的用户群体中表现出色:
- 天津 - 样本类型:人、猪、植物;建库试剂:第三方;测序方案:100%甲基化文库
- 武汉 - 样本类型:多样本混测(人、昆虫、水果、植物、鱼类等);建库试剂:第三方
- 上海 - 样本类型:人肿瘤样本;建库试剂:第三方
- 哈尔滨 - 样本类型:人标准品;建库试剂:MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30
测序性能
使用MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库,每12个甲基化文库进行了均匀pooling,不添加平衡文库,并于DNBSEQ-T7平台进行测序。每张芯片都能获得高reads产出,测序质量良好,确保实现DNBSEQ-T7平台的100%纯甲基化文库高质量测序。
数据利用率及质控
在多批次样本、建库试剂和不同起始量下进行的实验表明,使用MGI的全基因组甲基化软件MethyScope进行生信分析时,DNBSEQ-T7测序数据的clean rate≥99%,Uniquely Mapped Rate≥90%,Duplication Rate≤5%,平均测序深度均达到30x以上,全基因组覆盖度可达96%。质控显示文库的Lambda DNA非甲基化转化率≥99%,确保每批数据质量的一致性。
一致性及性能优势
在不同有效测序深度下,随机选取的NA12878甲基化文库所检测的独有及共有CpG位点,显示出94%的覆盖一致性与甲基化率一致性,这相较于其他建库测序方法显示出更优越的检测性能。此外,MGIWGMSV30结合DNBSEQ-T7的甲基化建库方法,在不同有效测序深度下,展示了与935K芯片的高一致性,检测位点数量更为丰富,相关性更高。
高效的混合测序
通过DNBSEQ-T7平台对WGMSV30文库、WGSPCR-free文库及RNA文库进行混合测序,实现了6300M以上的reads产出,Q30可达到96%。不同文库类型的成分比例接近理论值,确保了测序结果的高质量,证明尊龙凯时的产品在混合测序中的出色表现。
对未来的展望
在2024年,华大智造的DNBSEQ-T7平台持续获得生态伙伴的认可,吸引了凌恩生物、欧易生物、美吉生物等公司的引进。这不仅显示了DNBSEQ-T7在高效、高质及高性价比上的显著优势,也彰显了市场对尊龙凯时技术及产品的高度认可与信任。未来,华大智造将继续围绕生命科学的“读、写、存”开发更多灵活、多元化的生命解码工具,与全球生态伙伴携手推动生命科技的持续创新与发展。